关于百草门是否真实存在一直是玩家讨论的焦点。根据游戏内资料显示，百草门并非传统意义上的门派，而是一个与草药采集和奇遇任务高度关联的特殊体系。游戏中的百草门没有固定门派驻地，但其相关任务遍布各大地图，玩家需要通过特定方式触发才能接触到这个神秘组织的内容。
百草门的存在主要体现在游戏内的草药采集系统和奇遇任务链中。在桃花谷、药王谷等地图中，玩家可以找到诸如菩提参、阎王草等特殊草药，这些采集点往往与百草门的传说相关。比如菩提参的采集成就明确提示该草药位于药王谷区域，而阎王草则涉及到一个完整的奇遇任务链，玩家需要将其交给特定NPC才能完成任务。这些设计都暗示着游戏中存在一个专注于草药研究的隐世组织。
从游戏机制来看，百草门更像是一个分散在江湖各处的知识体系而非实体门派。在燕云州、昆仑山等区域的奇遇任务中，玩家会遇到与草药学识相关的NPC和剧情。比如燕云州的万里雄关奇遇需要在山海关处的阁楼建筑高台下进入孔洞触发，而昆仑山奇遇则要求玩家在雪堆处互动后进入山洞探索。这些任务设计都融入了草药辨识和使用的元素，进一步强化了百草门在游戏世界观中的存在感。
游戏中的采集成就系统也为百草门的存在提供了佐证。玩家在完成通幽古桥等奇遇任务时，需要收集特定草药作为任务物品。这些草药的分布位置和采集方式都经过精心设计，比如桃花谷的坐标(-105.-34)就是通幽古桥奇遇的关键触发点。这种将草药知识与地理环境紧密结合的设计思路，反映出开发者有意构建一个完整的草药学体系，也就是玩家口中的百草门。
虽然游戏没有明确设立这个门派，但通过分散在各大地图的草药点、相关NPC对话和任务剧情，成功塑造了一个隐于江湖的草药研究群体形象。对于喜欢探索游戏世界观的玩家来说，追寻百草门的踪迹不失为一种独特的游戏体验方式。
